home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00202 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  28 lines
  1. *********************************************************
  2. * Neuraxin and MAP1B proteins repeated region signature *
  3. *********************************************************
  4.  
  5. MAP1B [1], and neuraxin [2] are  neuronal microtubules binding proteins.  Both
  6. proteins contain  a region that consists of 12 tandem repeats of a 17 residues
  7. motif.
  8.  
  9. The pattern we developed to detect this  repeated  region  corresponds  to the
  10. N-terminal ten residues of the repeated region.
  11.  
  12. -Consensus pattern: [STAGDN]-Y-x-Y-E-x(2)-[DE]-[KR]-[STAGCI]
  13. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL;    this
  14.  pattern detects 8 out of the 12 copies of the repeated region.
  15. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 4 other proteins; but  in all cases
  16.  the pattern is only found once.
  17.  
  18. -Expert(s) to contact by email: Matus A.
  19.                                 matus@fmi.ch
  20.  
  21. -Last update: June 1994 / Text revised.
  22.  
  23. [ 1] Noble M., Lewis S.A., Cowan N.J.
  24.      J. Cell Biol. 109:3367-3376(1989).
  25. [ 2] Rienitz A., Grenningloh G., Hermans-Borgmeyer I., Kirsch J.,
  26.      Littauer U.Z., Prior P., Gundelfinger E.D., Schmitt B., Betz H.
  27.      EMBO J. 8:2879-2888(1989).
  28.